El COVID-19 es una enfermedad potencialmente mortal que es un gran problema de salud pública mundial y es causada por el virus SARS-CoV-2. Hasta la fecha, más de 25 millones de personas en todo el mundo se han infectado, causando más de 800 mil muertes, y Perú se encuentra en el quinto lugar mundial con casi 650 mil casos y es el segundo país con la mayor tasa de mortalidad, con casi 5%. La secuenciación genómica de pacientes con SARS-CoV2 permite rastrear la epidemiologia y evolución del virus para informar políticas de manejo. Diferentes países están haciendo esfuerzos en este sentido, a nivel nacional bajo sus propias condiciones.
El 1 y 2 de octubre se llevará a cabo un simposio internacional sobre “El Genoma de SARS-CoV2, su evolución y epidemiologia en América Latina”, con la finalidad de aprender de otros países y fomentar oportunidades de colaboración internacional. En vista que hay varios proyectos activos en Perú, cuyas experiencias pueden compartirse con la posibilidad de explorar posibilidades de colaboración para acelerar las investigaciones en este campo, se ha visto por conveniente realizar un simposio nacional el 5 de octubre en el cual se tratarán temas enfocados en proyectos de diagnóstico y secuenciación de SARS-CoV2, análisis bioinformáticos con resultados que arrojan un mejor entendimiento de la epidemiologia, y recomendaciones para manejar la pandemia a nivel nacional y regional.
Este simposio es organizado en coordinación con el Instituto Nacional de Salud (INS), el Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica (CONCYTEC), la Universidad San Martin de Porres (USMP) y el proyecto CABANA el cual busca incrementar las capacidades y fomentar la colaboración en bio-informática en América Latina para enfrentar los retos de alimentación, salud humana y conservación de biodiversidad.
- Compartir experiencias de investigaciones y resultados de proyectos de secuenciación y diagnóstico de SARS-CoV2 para manejo de la pandemia en Perú. Se presentarán los proyectos, avances, enfoques y retos por representantes de diferentes laboratorios e instituciones, culminando con una discusión abierta con los panelistas para estimular la interacción y temas de seguimiento, con la finalidad de incrementar la capacidad y colaboración bio-informática en Perú.
Bienvenida e introducción
Ricardo Fujita
Retos y aportes para el desarrollo de la CTI en tiempo de Pandemia por COVID-19
Ana Sobarzo Arteaga
Vigilancia Molecular de SARS-CoV-2 por el INS en Perú
Ronnie Gavilan
Factores biológicos del hospedero en COVID-19
Ricardo Fujita
Sistema descentralizado para vigilancia de SARS-CoV-2
Pablo Tsukayama
Mariana Leguía
Diagnóstico molecular innovador en tiempos de COVID-19: desarrollo y validación de una prueba de detección molecular de SARS-CoV-2 basada en tecnología CRISPR/Cas12a
Vanessa Adaui
Pausa
Desarrollo de una vacuna para COVID-19
Mirko Zimic
Vigilancia usando metagenómica viral, la importancia de flujos de trabajo bio-informáticas y cómo puede ayudar el proyecto CABANA
Jan Kreuze
Desarrollo de pruebas moleculares isotérminas para la detección del SARS-CoV2.
Mónica Pajuelo
Global geographic and temporal analysis of sars-cov-2 haplotypes normalized by covid-19 cases
Santiago Justo
Estimación filodinámica del número reproductivo efectivo (Rt) en Perú durante las primeras semanas de la pandemia causada por SARS-CoV-2 usando genomas virales
Pedro Romero
Virtual screening exhaustivo de 4887 flavonoides: nuevas impresiones sobre la inhibición estructural de la Mpro del SARS-CoV-2.
Ana Paula Vargas
Diversidad genética del HLA en Sudamérica: Oportunidades en COVID-19 y otras enfermedades.
Manuel Ramírez
Panel de discusión: ¿Cuáles son los retos y cuáles podrían ser los mecanismos de soporte y colaboración a nivel nacional para enfrentarlos?
El Dr. Jan Kreuze ha estado trabajando en el Centro Internacional de la Papa (CIP) en temas relacionados con la biotecnología, incluido el desarrollo transgénico y el diagnóstico de virus desde 2003. Tiene una maestría en fitomejoramiento de la Universidad de Wageningen en 1997 y un doctorado en virología que obtuvo en la Universidad Sueca de Ciencias Agrícolas en 2002. Además de su posición de líder de la división de ciencias de cultivos y sistemas de cultivos en el CIP, es profesor adjunto en virología de plantas en la Universidad de Helsinki. Es autor de más de 90 publicaciones internacionales revisadas por pares, incluidos libros y capítulos de libros en los campos de fitopatología, diagnóstico, genética y biotecnología, y forma parte del consejo editorial de dos revistas científicas internacionales y el Comité internacional de taxonomía de los virus (ICTV). Actualmente, sus esfuerzos de investigación se centran en la caracterización y el diagnóstico de enfermedades virales en la papa y el camote, la evaluación del riesgo de enfermedades mediante el modelado
Dr. Jan F. Kreuze
Jefe de las unidades de virología y de cuarentena, CIP
- Estudió Biología (orientación Genética) U. San Marcos, MSc. y Ph.D. en Genética Molecular, Université de Strasbourg , Francia. Post-doctorado y docente investigador, University of Michigan School of Medicine, Ann Arbor, EEUU.
– Director del Centro de Genética y Biología Molecular (CGBM), Facultad de Medicina, USMP. - Proyectos vigentes en el CGBM están asociados con Genética Humana. Las líneas son reconstrucción de la historia de los pueblos peruanos por la genética. Así como también enfermedades raras, crónicas, cáncer, inmunogenética, farmacogenética, bioinformática, fisiología celular y terapia basada en genética.
- Miembro Honorario del Colegio de Biólogos del Perú.Miembro de Número de la Academia Nacional de Ciencias. Vocal de la Asociación Latinoamericana de Genética. Miembro del Human Genome Organization.
- -Participa o participó en Proyectos financiados por CONCyTEC, FONDECyT, FINCyT, Proyecto Genographic (NatonalGeographic Society), Proyecto Horizonte 2020 (CCEE), Proyecto CABANA (Capacity Building for Bioinformatics in Latin America), y otros.
Ricardo Fujita
Director Centro de Genética y Biología Molecular, Universidad San Martin de Porres
Bióloga Marina egresada de la Universidad de Concepción Chile y candidata a obtener el grado de Maestría en Políticas y Gestión de la Ciencia, Tecnología e Innovación de la UPCH. Ex-Gerente General empresa BIOINCUBA de la Universidad Peruana Cayetano Heredia, he sido jefe de la Oficina de Transferencia de Tecnología y Propiedad Intelectual de la Universidad Cayetano Heredia. Ha negociado 21 contratos con empresas en el marco de los proyectos FIDECOM, FINCYT y Privados, además de gestionar la Propiedad Intelectual y Transferencia Tecnológica, participó como delegada de la Universidad Peruana Cayetano Heredia en diferentes comisiones nacionales relacionadas con la Ciencia, Tecnología e Innovación, tales como: Comité Técnico de Formulación del Programa Nacional de Ciencia y Tecnología Valorización de la Biodiversidad, Acuerdo Nacional, Concejo Nacional de Competitividad, CODET, Comité de Investigación, Desarrollo tecnológico e Innovación, Comisión Nacional de Promoción del Biocomercio.
Actualmente se desempeña como Sub Directora de Innovación y Transferencia Tecnológica, en el Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica CONCYTEC, Perú
Ana Sobarzo Arteaga
Sub Directora de Innovación y Transferencia Tecnológica – SDIIT, Dirección de Políticas y Programas de CTI, CONCYTEC
Ronnie Gavilán
Director de Oficina Ejecutiva de Enfermedades Transmisibles, Instituto Nacional de Salud
- Biología, UPCH, 2004
- PhD Microbiología Molecular, Washington University en St. Louis, EEUU, 2015
- MSc Salud Pública, Escuela de Medicina Tropical de Londres, Reino Unido, 2017
- Profesor en la Facultad de Ciencias de la UPCH, 2017
- Investigador principal del Laboratorio de Genómica Microbiana, UPCH
- International Fellow, Wellcome Sanger Institute, Reino Unido, 2020
Pablo Tsukayama
PhD, Laboratorio de Genómica Microbiana | Departamento de Ciencias Celulares y Moleculares | Facultad de Ciencias y Filosofía, Universidad Peruana Cayetano Heredia
Mariana Leguía obtuvo un Doctorado en Biología Molecular, Celular y Bioquímica de la Universidad de Brown (Rhode Island, USA) en el 2005. Después cursó estudios de post-doctorado en el Lawrence Berkeley National Laboratory (Berkeley, USA) y en la Universidad de California (Berkeley, USA), donde se enfocó en el área de Biología Sintética. En el 2011 retornó al Perú, donde se desempeñó como Directora de la Unidad de Genómica y Descubrimiento de Patógenos del U.S. Naval Medical Research Unit No. 6 (Lima, Perú). Desde Enero del 2018 dirije el Laboratorio de Genómica de la Pontifica Universidad Católica del Perú. Su área de interés son las enfermedades infecciosas y cómo estas afectan a la salud pública en el Perú y el mundo. Su enfoque científico es la utilización de técnicas genómicas avanzadas, como el secuenciamiento de última generación, el RNA-seq y el ribosome profiling, con la finalidad de desarrollar diagnósticos para enfermedades tropicales, optimizar vacunas contra ellas, encontrar marcadores genómicos de riesgo, y descubrir patógenos nuevos que puedan afectar la salud humana y animal.
Mariana Leguía
Directora, Laboratorio de Genómica, Vicerrectorado de Investigación, Pontificia Universidad Católica del Perú
Bachiller en Biología y Magíster en Bioquímica y Biología Molecular por la Universidad Peruana Cayetano Heredia, y Doctora en Ciencias Biomédicas por la Universidad de Amberes en Bélgica. Actualmente es Investigadora en la Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas. Desde el 2003 se dedica a la investigación en enfermedades infecciosas y tropicales, con especial interés en leishmaniosis cutánea. Como docente e investigadora ha contribuido a la formación académica-científica a nivel de pre- y posgrado.
Vanessa Karina Adaui Sicheri
Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas
Físico graduado en la Universidad Nacional de Ingeniería de Lima, Perú, el Dr. Zimic tiene una maestría en Bioquímica de la Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH). También tiene una Maestría en Bioestadística y Epidemiología Genética y un Doctorado en Control y Prevención de Enfermedades de la Universidad Johns Hopkins.
El Dr. Zimic es profesor principal del departamento de Ciencias Celulares y Moleculares, y es el jefe del laboratorio de Bioinformática, Biología Molecular y Desarrollo Tecnológico de la Facultad de Ciencias de la UPCH, y miembro de la Academia Nacional de Ciencias del Perú.
Sus investigaciones están muy relacionadas con los mecanismos de resistencia a los medicamentos y con el desarrollo de enfoques rentables para el diagnóstico de enfermedades infecciosas y no infecciosas.
Las capacidades innovadoras del Dr. Zimic ya han producido un sistema automatizado de vigilancia e interpretación por vídeo del cultivo de la tuberculosis, que está siendo adoptado por el Ministerio de Salud del Perú, y también está desarrollando una serie de iniciativas en telemedicina y telediagnóstico, específicamente en tuberculosis, cisticercosis, norovirus, enfermedad de Chagas, neumonía, malnutrición, cáncer cervical, cáncer de piel, autismo y anemia.
Su grupo estudia el mecanismo de acción y resistencia a la pirazinamida en Mycobacterium tuberculosis, y recientemente está empezando a aplicar técnicas de inmunoinformática para analizar los genomas completos de los patógenos con el fin de desarrollar racionalmente nuevos antígenos de inmunodiagnóstico y posibles vacunas. Su grupo secuenció dos de los cuatro genomas disponibles de T. solium y secuenció y analizó unos 2.800 genomas de aislamientos clínicos de M. tuberculosis. Actualmente se está analizando el transcriptoma de M. tuberculosis para buscar potenciales bombas de efluvios de drogas, mientras se utiliza CRISPRi para detectar genes asociados al mecanismo de acción/resistencia de las drogas anti-tuberculosas.
Mirko Zimic
Profesor Principal/Jefe del Laboratorio de Bioinformática, Biología Molecular y Desarrollos Tecnológicos, Universidad Peruana Cayetano Heredia
Mónica Pajuelo Travezaño es investigadora en Salud Pública en el área de epidemiología y control de enfermedades infecciosas, jefa del Laboratorio de Microbiología Molecular de la Facultad de Ciencias y Filosofía en la Universidad Peruana Cayetano Heredia. Docente de dicha universidad y Profesora asociada al Departamento de Salud Internacional en la Escuela de Salud Pública de la Universidad Johns Hopkins en EEUU, donde obtuvo su grado de Ph.D.
Mónica Pajuelo
Jefa de la Carrera Farmacia y Bioquímica, Facultad de Ciencias y Filosofía, Universidad Peruana Cayetano Heredia
Soy Estudiante de Doctorado en el Instituto de Química de la Universidad de Sao Paulo, trabajo con Enzimologia Estructural en el grupo del Prof. Shaker Chuck Farah en el Instituto de Química de la USP
Egresado de la Universidad Ricardo Palma y Líder del equipo de investigación de seguimiento de mutaciones y haplotipos de SARS-CoV-2 de la Facultad de Ciencias Biológicas, Líder del equipo que desarrollo la página web SARS-CoV-2 haplofinder URP http://sarscov2haplofinder.urp.edu.pe/
Más información puede ser encontrada en mi orcid: https://orcid.org/0000-0001-8833-4395
Santiago Justo
Universidad Ricardo Palma
Investigador postdoctoral en la Universidad Peruana Cayetano Heredia en el marco del proyecto Incorporación de Investigadores financiado por FONDECYT.
Doctor en Ciencias Naturales por la Universidad Goethe – Frankfurt, Alemania. Mi investigación se enfoca en el estudio de la biodiversidad a la luz de la evolución. Tengo intereses en la implementación de herramientas bioinformáticas para el análisis genómico, filogenético y filogeográfíco, así como en el fortalecimiento de capacidades en bioinformática de la comunidad científica peruana.
Pedro Eduardo Romero Condori
Investigador postdoctoral/Docente, Universidad Peruana Cayetano Heredia
Ana Paula Vargas Ruiz es Licenciada en Biología por la Universidad Peruana Cayetano Heredia, donde se desempeña como asistente de investigación en el Laboratorio de Bioinformática y Biología Molecular. Tiene amplia experiencia en bioinformática por su trabajo como estudiante de pregrado, donde participó en intercambios en la Universidad de Pensilvania y la Universidad de Vanderbilt. Su interés es en bioquímica y biología estructural, que hoy en día explora usando métodos computacionales. Actualmente, se encuentra participando de proyectos para combatir la COVID.19.
Ana Paula Vargas Ruiz
Licenciada en Biología, Universidad Peruana Cayetano Heredia
Manuel Alain Ramírez Sáenz es Bachiller en Ciencias Biológicas con especialidad en Genética y Biotecnología en la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, estudiante de la Maestría de Inmunología Básica y Clínica de la Universidad Peruana Cayetano. Combina su experiencia universitaria con las áreas de Computación, Genómica, Bioinformática e Inmunología. Con experiencia bioinformática como asistente de investigación en la Unidad de Genómica y el Laboratorio de Bioinformática y Biología Molecular ambos en la Universidad Peruana Cayetano Heredia. Actualmente, labora en el área de bioinformática en el Centro de Investigaciones Tecnológicas, Biomédicas y Medioambientales, ubicado en la UNMSM.
Manuel Alain Ramírez Sáenz
Bachiller en Ciencias Biológicas, Centro de Investigaciones Tecnológicas, Biomédicas y Medioambientales, Universidad Nacional Mayor de San Marcos